2003年，方勇纯从美国康奈尔大学回国任教，被聘为南开大学校特聘教授（当时校级最高人才岗位），是当时南开大学最年轻的教授和博士生导师。方勇纯创建了南开大学欠驱动机器人团队，现有平台包括：

·     全国高校黄大年式教师团队：“智能科技教师团队”，2023年获批，方勇纯为负责人；

·     教育部111引智基地：“机器人智能感知，控制及应用学科创新引智基地”，2020年获批，方勇纯为负责人；

·     天津市重点领域创新团队：“智能机器人与智能系统创新团队”，2016年获批，方勇纯为负责人；

·     天津市国际合作基地：机器人与自动化国际联合研究中心，2016年获批，方勇纯为负责人；

·     天津市“131”创新型人才团队：“机器人控制创新团队”，2015年获批，方勇纯为带头人。

       依托以上平台，截至目前，方勇纯已培养17位博士，其中，10人进入高校，1人进入研究实验室，6人进入企业工作。进入高校工作的10人中，3人晋升为正教授，其中，2人入选了教育部青年长江学者；3人晋升为副教授/副研究员。近年毕业的一位直博生，博士在读期间入选中国大学生年度人物（全国当年共20名入选者）。

·        机器人高性能技能学习系统研究，企业横向项目，项目负责人，300万，在研

·       智能化起重机作业控制系统开发，揭榜挂帅项目，项目负责人，600万，在研

·       面向地下空间探测的多感融合空地两用多模态机器人系统及关键技术，国家自然科学基金重点项目，项目负责人，直接经费289万，在研

·       面向有色金属浇铸过程的机器人作业系统，“智能机器人”国家重点研发计划，项目负责人，总经费4402万（国拨经费1342万），结题

·       多无人机协同吊运方法研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人，直接经费65万，结题

·       智能吊运系统，深圳市盐田区科创局，首席科学家，900万，在研

·       面向细胞局部精准置换的自动纳米操控方法研究，国家基金重点项目，项目负责人，直接经费270万，结题

·       智能与自主机器人，国家杰出青年科学基金，项目负责人，320万，结题

·       回转旋臂式船用起重机系统动力学建模与非线性控制，国家自然科学基金，项目负责人，80万，结题

·       安全高效自动桥式吊车关键技术与系统集成，国家“十二五”科技支撑计划，项目负责人，总经费973万（其中国拨经费473万元），结题

·       面向生命科学的跨尺度快速AFM系统研制，国家基金科学仪器基础研究专款，项目负责人，280万，结题

·       面向生物组织的显微操作技术与装备，国家863计划重点，项目负责人，476万，结题

·       基于能量分析的欠驱动非线性吊车控制系统设计，国家自然科学基金，项目负责人，30万，结题

·       高性能非接触原子力显微镜系统设计，国家自然科学基金，项目负责人，23万，结题

近期代表性论文：

·        Shizhen Wu, Yongchun Fang*, Geometric Maneuvering for Underactuated VTOL Vehicles, IEEE Transactions on Automatic Control, Vol. 69, No. 3, pp. 1507-1519, Mar. 2024.

·       Tianci Wen, Yongchun Fang*, Biao Lu, Xuebo Zhang, Chaoquan Tang, LIVER: ATightly Coupled LiDAR-Inertial-Visual State Estimator with High Robustness for Underground Environments, IEEE Robotics and Automation Letters (RA-L), Vol. 9, No. 3, pp. 2399-2406, Mar. 2024.

·       Qianqian Cao, ZiyiLiu, Hai Yu, Xiao Liang, Yongchun Fang*, Autonomous Landing of the Quadrotor on the Mobile Platform via Meta Reinforcement Learning, IEEE Transactions on Automation Science and Engineering, Accepted.

·       Biao Lu, Yongchun Fang*, Online Trajectory Planning Control for a Class of Underactuated Mechanical Systems, IEEE Transactions on Automatic Control, Vol. 69, No. 1, pp. 442-448, Jan. 2024.

·       R. Song, Y. Fang*,Haoqian Huang, Reliable Estimation of Automotive States based on OptimizedNeural Networks and Moving Horizon Estimator, IEEE/ASME Transactions onMechatronics, Vol. 28, No. 6, pp. 3238-3249, Dec. 2023.

·       Wei Huang, Xian Guo, Huawang Liu, Yongchun Fang*, A Robust Model-based Radius Estimation Approach for Helical Climbing Motion of Snake Robots, IEEE/ASME Transactions on Mechatronics, Vol. 28,No. 6, pp. 3284-3293, Dec. 2023.

·      Chen Qian, Yongchun Fang*, Youpeng Li, Neural Network-Based Hybrid Three-Dimensional Position Control for a Flapping Wing Aerial Vehicle, IEEE Transactions on Cybernetics, Vol. 53, No. 10, pp. 539-548, pp. 6095-6018, Oct. 2023.

·       Hean Hua, Yongchun Fang*, A Novel Reinforcement Learning-Based RobustControl Strategy for a Quadrotor, IEEETransactions on Industrial Electronics, Vol. 70, No. 3, pp. 2812-2821, Mar.2023.

·       Xiao Liang, Hai Yu, Zhuang Zhang, Huawang Liu, Yongchun Fang*, JiandaHan*, Unmanned Aerial Transportation System with Flexible Connection betweenthe Quadrotor and the Payload: Modeling, Controller Design and ExperimentalValidation, IEEE Transactions onIndustrial Electronics, Vol. 70, No. 2, pp. 1870-1882, Feb. 2023.

·       Hean Hua, Yongchun Fang*, Xuetao Zhang, Qian Chen, A New Nonlinear Control Strategy Embedded with Reinforcement Learning for a Multirotor Transporting a Suspended Payload, IEEE Transactions on Mechatronics, Vol. 27, No. 2, pp. 1174-1184, Apr. 2022.

·      Yinan Wu, Zhi Fan, Yongchun Fang*, Cunhuan Liu, An intelligent AFM scanning strategy based on autonomous exploration, IEEE/ASME Transactions on Mechatronics, Vol. 27, No. 3, pp. 1750-1760,June 2022.

·      Biao Lu, Haixin Cao, Yunsong Hao, Jingzheng Lin and Yongchun Fang*, Online Anti-swing Trajectory Planning for a Practical Rubber Tire Container Gantry Crane, IEEE Transactions on Industrial Electronics, Vol. 69, No. 6, pp. 6193-6203, Jun. 2022.

·       Hean Hua, Yongchun Fang*, Xuetao Zhang, Qian Chen, A New Nonlinear Control Strategy Embedded with Reinforcement Learning for a Multirotor Transporting a Suspended Payload, IEEE Transactions on Mechatronics, Vol. 27, No. 2, pp. 1174-1184, Apr. 2022.

·       Hean Hua, Yongchun Fang*, Xuetao Zhang, Biao Lu, A Novel Robust Observer-based Nonlinear Trajectory Tracking Control Strategy for Quadrotors, IEEE Transactions on Control Systems Technology, Vol. 29, No. 5, pp. 1952-1963, Sep. 2021.

·       Xiao Liang, Yongchun Fang*, Ning Sun, He Lin, Xingang Zhao, Adaptive Nonlinear Hierarchical Control for a Rotorcraft Transporting a Cable-Suspended Payload, IEEE Transactions on Systems,Man and Cybernetics: Systems, 51(7): 4171–4182, July 2021.

·       Xiao Liang, Peng Zhang, Yongchun Fang*, He Lin, Wei He, Nonlinear Control for AerialTransportation Systems with Double-Pendulum Swing Effects, IEEE Transactions on Industrial Electronics, Vol. 68, No. 7, pp. 6020-6030,July 2021.

·       Biao Lu, Yongchun Fang*, Gain-Adapting Coupling Control for a Class of Underactuated Mechanical Systems, Automatica,125 (2021) 109461, pp. 1-7.

·       文天赐，方勇纯*，卢彪，采用神经网络的双吊车自适应防摆控制，自动化学报, Vol. 49, No. 1, pp. 111-121，2023年。

·       林静正，方勇纯*，卢彪，郝运嵩，曹海昕，基于迭代学习和神经网络的船用起重机控制方法研究，控制理论与应用，39(4): 602-612, 2022年。

·       钱辰，方勇纯*，李友朋，面向扑翼飞行控制的建模与奇异摄动分析，自动化学报，48(2): 434−443，2022年。

·       何慰, 方勇纯*, 梁潇, 张鹏. 一种两自由度飞行机械臂系统的设计与实现. 航空学报, 2021, 42(2):324280-324280，2021年。

·       余慧瑾，方勇纯*，韦知辛，基于多传感融合的自主发育网络场景识别方法研究，机器人，Vol. 43, No. 6, pp. 706-714，2021年。

·       王超，武毅男*，方勇纯，樊志，刘存桓，面向柔软样品的AFM纳米操作可视化系统，机器人，43(3): 331-339，2021年。

·       余慧瑾，方勇纯*，基于改进型自主发育网络的机器人场景识别方法，自动化学报，47(7): 1530-1538, 2021年。

·       华和安, 方勇纯*, 钱辰, 张雪涛. 基于线性滤波器的四旋翼无人机强化学习控制策略. 电子与信息学报, 43(12): 3407-3417, 2021年。

·        教育部科技委脑科学与认知科学专门委员会委员

·        教育部人工智能高层次人才培养专家委员会委员

·        教育部高等学校电子信息类专业教学指导委员会——人工智能专业建设咨询委员会委员

·        教育部高等学校自动化类专业教学指导委员会委员

·        中国自动化学会教育工作委员会委员

·        中国自动化学会机器人智能专业委员会，副主任委员

·        天津市智能科学与技术研究会，副会长

·        天津市图像图形学学会，副理事长

·        2023年，高等教育（本科）国家教学成果二等奖

·        2022年，高等教育（研究生）天津市教学成果一等奖

·        2020年，指导的博士生卢彪入选第十五届“中国大学生年度人物”（全国20人入选）

·        2019年，方勇纯，南开大学首届教育教学奖-杰出贡献奖

·        2019年，指导的学生团队（卢彪为学生负责人）荣获2019年全国互联网+创新创业大赛国赛金奖

·        2019年，朱威等同学获“挑战杯”全国三等奖（指导教师：郭宪，方勇纯）

·        2019年，方勇纯等，智能工业起重机研究成果入选2019中国智能制造十大科技进展

·        2018年，方勇纯等，天津市自然科学一等奖

·        2018年，方勇纯等，天津市教学成果一等奖

·        2018年，方勇纯，陈翰馥奖

·        2018年，吴易鸣等获第十一届中国青少年科技创新奖（指导教师：孙宁，方勇纯）

·        2017年，方勇纯等，天津市专利金奖

·        2017年，方勇纯等，第七届吴文俊人工智能自然科学奖一等奖

·        2017年，方勇纯，中国自动化学会青年科学家奖